Se você não é um usuário avançado ou desenvolvedor que cria programas, o rastreador de dependências existe para marcar o pacote obsoleto.
Basta executar
sudo apt-get autoremove
para remover a dependência não utilizada.
Além disso, se você quiser limpar os arquivos de cache baixados (instaladores em /var/cache/apt/archives
que são usados para instalação, você pode executar
sudo apt-get clean