Não há mecanismo de estatísticas incorporado para fornecer a você qualquer tipo de estatística de consulta por domínio.
Em cima da minha cabeça, posso pensar em duas coisas que você poderia fazer:
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Use o Wireshark (provavelmente a versão "somente texto", "tshark") para capturar as consultas DNS recebidas aos arquivos. Você poderia analisar os arquivos e relatar sobre eles.
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Ative a funcionalidade "Debug Logging" no servidor DNS (nas "Propriedades" do servidor DNS), marcando apenas as caixas "Incoming", "UDP", "Queries" e "Request" ". Você terá que analisar o arquivo de log que o servidor DNS gera, mas pode ser mais fácil do que analisar a saída do Wireshark.