Se você não estiver familiarizado com servidores não-GUI (somente texto), e você vai usar o LAMP (como mencionado no site do Moodle) para hospedar seu site com o Moodle (ou qualquer outro CMS como Joomla, Wordpress pessoalmente não posso dizer as diferenças ou poderes especiais do Moodle). Então você deve experimentar o Ubuntu Desktop (versão comum) e fazer com que ele não execute nenhum ambiente de desktop nem interface gráfica na inicialização.
Dessa forma, se você precisar fazer alguma coisa, basta iniciar a GUI e seu ambiente de área de trabalho favorito para fazer as alterações / testes necessários.
Se você optar por instalar a edição do servidor, poderá usar ferramentas não gráficas para administrar seus arquivos / pastas (o comando midnight para navegação, nano, vim / emacs para editar arquivos e muitas ferramentas úteis baseadas em texto).
Não posso fornecer suporte para a conta de administração remota, mas se você instalar serviços on-line, poderá editar arquivos da web diretamente da sua página da web. Verifique o projeto eXtplorer para navegação / edição de arquivos, phpMyAdmin para editar Bancos de Dados MySQL e se você tiver uma necessidade especial por favor coloque uma nova questão com tal necessidade para obter o suporte apropriado.
Como tudo está funcionando para ficar on-line (como documentos em serviços da Web, etc.), você deve considerar a instalação de serviços suficientes que permitem fazer o que for necessário. Existem serviços para editar seu PHP, HTML, CSS e outros arquivos populares diretamente do site, para que você não precise obter acesso ao servidor apenas para fazer pequenas alterações. No entanto, você deve considerar reunir o suporte adequado para ter a conta de administração remota para poder executar tarefas poderosas diretamente no servidor.
O que eu mencionei é baseado em minha própria experiência usando um servidor web baseado em desktop no qual você pode obter acesso aos arquivos / pastas e certas administrações (como permissões de arquivos / pastas, etc.) usando serviços baseados na web como aqueles Eu mencionei aqui.
Boa sorte!