Há situações em que você observa uma alta média de carga combinada com baixo uso da CPU, consulte esta discussão por algumas razões possíveis. O artigo da Wikipedia sobre o carregamento também é bastante informativo.
O problema é que algumas dessas situações são inofensivas (eu costumava gerenciar um servidor Informix no HPUX onde a média de carga era igual ao número de VPs do Informix configurados, mesmo quando ociosos), quando é algum tipo de IO relacionado a ele pode retardar bastante o processamento - veja o exemplo no artigo vinculado.
Se o sistema "parecer" responsivo, eu não me preocuparia muito, mas como você tem métricas de servidor disponíveis (vejo que você tem o sealion instalado), eu daria uma olhada nos valores relacionados a IO, isso pode ajudá-lo a entender seu sistema melhor e evitar surpresas mais tarde.