É perfeitamente possível ... Tipo. Microsoft produz uma ferramenta para sincronizar contas do AD com o Office 365 (DirSync, que é discutido aqui ) e ferramentas para criar contas 'locais' para o O365 em massa (Powershell com um arquivo CSV de usuários, discutido aqui ). O MS também permite que você autenticar via ADFS para efetuar login no O365 usando contas que fazem parte do seu AD local.
Estritamente falando, eles podem não ser "Microsoft Accounts" da mesma maneira que uma conta do outlook.com para "[email protected]", mas essas soluções permitem que usuários corporativos se autentiquem para usar os serviços de nuvem da Microsoft.