Eu acho que tecnicamente dentro de um único domínio de configuração de floresta você realmente não precisa de GCs.
Eles serão úteis se seus links não forem confiáveis entre sites.
Em termos de reconstrução, a informação é lida a partir do próprio AD, portanto, não precisa realmente de ser reconstruída. Para atribuir um novo, basta usar a ferramenta Sites e Serviços.
COMO "apenas um GC na matriz" Acredito que, como nem todos os seus DCs são GCs, o administrador anterior está tentando evitar o problema de ter a função FSMO da Infraestrutura Mestre hospedada em um GC. Não me lembro dos detalhes exatos do problema, mas normalmente é melhor hospedá-lo em um não-GC ou ter todos os CDs como GCs.
Em termos de "problemas", habilitando o GC em outros servidores, não posso prever nenhum, mas suponho que você deva perguntar por que você os está usando ou que benefícios você acha que obterá com eles. Seu principal objetivo é manter a participação no grupo Universal, então, se você não tem muitos grupos da Universal, isso pode ser bastante irrelevante.