De acordo com a documentação, você pode colocar essas diretivas em uma tag <Directory>
na configuração do seu apache: mod_expires # ExpiresActive
Por exemplo, assim:
<Directory /var/www/js/expire_fast>
<IfModule mod_expires.c>
ExpiresActive On
ExpiresByType text/javascript "access plus 60 minutes"
</IfModule>
</Directory>