Se você está disposto a gastar um pouco de dinheiro para obter relatórios que são facilmente gerados e fáceis de ler, eu recomendo o File System Auditor pelo Scriptlogic.
Este software permite criar relatórios personalizados mostrando qualquer atividade em qualquer pasta, por qualquer usuário e qualquer tipo de evento. É muito mais fácil ler e usar ordens do que a auditoria padrão incorporada no Windows Server. Eu o uso no meu servidor de arquivos que está executando o Server 2003, mas tenho certeza que funcionará bem em 2008 também.