Você terá que alterar manualmente o nome. Não existe um método dentro do VMware que altere os nomes dos arquivos.
Se eu me lembro, os nomes dos arquivos também são armazenados no arquivo .vmx. Este é apenas um arquivo de texto simples que você pode editar no Bloco de Notas.
Depois de alterar as referências do nome do arquivo, você deve ser capaz de renomear os arquivos e o sistema deve ser executado sob o novo nome.
Por favor, faça um backup do arquivo .vmx primeiro: -)