A adição simples de uma barra no seu local deve fazer nginx
executar a mesma transformação implicitamente.
location /api/ {
proxy_pass http://nodeapp:3000/;
proxy_set_header Host $host;
proxy_set_header X-Real-IP $remote_addr;
proxy_set_header X-Forwarded_For $proxy_add_x_forwarded_for;
}
Veja este documento para detalhes.