Coloque simplesmente qualquer coisa que esteja preparado para perder quando a instância terminar e você perder os dados em sua unidade efêmera.
Como você já apontou, um ótimo caso de uso são os arquivos temporários.
Eu suspeito que a maioria dos seus arquivos relacionados a banco de dados e software precisam viver em um volume suportado pelo EBS.
Você pode aumentar o desempenho dos volumes com suporte do EBS provisionando IOPS mais altos.
Você também deve criar um perfil de seu aplicativo e descobrir onde e como ele está lento. Você pode se beneficiar de melhor CPU e mais memória RAM.
Por fim, você pode melhorar seu aplicativo, por exemplo, usando indexação em seu banco de dados ou consultas mais eficientes. Arquivos estáticos podem ser servidos fora do CloudFront (CDN) para o seu servidor da Web.