Eu estava tentando resolver o desaparecimento do ícone do NetworkManager e, seguindo algumas dicas, executei este comando:
rm -rf ~/.gconf/apps/panel
Não só não funcionou, mas as decorações das janelas também desapareceram (título, botão de fechamento, etc) e quem sabe o que mais eu não notei.
Eu encontrei a outra pergunta sobre esse problema, mas quero uma solução permanente ... executando metacity --replace corrige o problema até o próximo login e o adiciona aos comandos de inicialização. Eu quero desfazer o dano, não colocar fita adesiva sobre ele.
Nota: Ubuntu 10.10 com compiz
Nova solução (parcial):
gconftool --recursive-unset /apps/panel
rm -rf ~/.gconf/apps/panel
pkill gnome-panel
Eu não sei exatamente o que está sendo feito aqui (removendo uma pasta, matando um processo), mas minhas decorações e ícones estão de volta. Ele removeu ícones adicionais que eu tinha definido no painel, e pode ter desativado algumas configurações de compiz (não tenho certeza sobre isso, poderia ser efeito colateral anterior de minhas várias 'correções'), nada sério.
Infelizmente, na próxima reinicialização completa, as decorações estão faltando novamente.
Tente reinstalar os painéis do gnome
sudo apt-get install --reinstall gnome-panel
E para o problema do applet do Gerenciador de rede, se ele ainda não tiver sido corrigido, edite o gerenciador de rede conf
sudoedit /etc/NetworkManager/nm-system-settings.conf
e altere managed=false para managed=true e salve o arquivo. No terminal, digite killall nm-system-settings e reinicie.