Minha leitura da sua pergunta é que, depois que um usuário importou uma chave no console da AWS, você gostaria de uma maneira de importar essa nova chave para as instâncias reais automaticamente. Infelizmente, as describe-key-pairs
chamadas da API retornam a chave privada impressão digital, não a chave pública completa.
Se você tem uma equipe tecnicamente experiente usando isso, fazer com que eles façam upload para um bucket do S3 ou um servidor em algum lugar pode ser sua melhor opção.