Dependeria do que é o sistema de arquivos atualmente em seu disco rígido. Se você já tinha uma versão mais antiga do Ubuntu, a resposta é sim. Observe, no entanto, se você não particionou corretamente seu disco rígido para ter /home em sua própria partição, provavelmente perderá todas as suas informações.
Se você não tem essa partição, pode não ser tarde demais. Dependendo de quanto espaço livre você tem atualmente no seu disco rígido, você pode criar uma nova partição EXT4 e copiar todos os seus arquivos lá. Então, quando você instala o Ubuntu, apenas se certifica de não formatar essa partição.
Se você fornecer informações adicionais, poderemos editar a resposta para ser mais específica.