Este pacote não tem uma interface gráfica de usuário (GUI) e precisa ser usado apenas a partir de um Terminal. Bastante confuso, o comando para executar Gnuboy-x é, na verdade, xgnuboy e as opções são as seguintes:
andrew@athens:~$ xgnuboy --help
gnuboy 1.0.3
Usage: xgnuboy [options] romfile
--source FILE read rc commands from FILE
--bind KEY COMMAND bind KEY to perform COMMAND
--VAR=VALUE set rc variable VAR to VALUE
--VAR set VAR to 1 (turn on boolean options)
--no-VAR set VAR to 0 (turn off boolean options)
--showvars list all available rc variables
--help display this help and exit
--version output version information and exit
--copying show copying permissions
andrew@athens:~$
No entanto, esta aplicação funcionou mal no meu próprio sistema, na minha opinião, melhor usar vbaexpress que tem o bom gui que você está procurando e que pode ser simplesmente instalado da seguinte forma:
sudo apt-get install vbaexpress
Isso me fez jogar roms do GameBoy em pouco tempo:
A rom específica que testei pode ser encontrada aqui ...