Estou assumindo que o Dynamics tem seu próprio site e não usa o website padrão. Isso pode estar totalmente incorreto.
De qualquer forma, se eles são sites separados, por que você simplesmente não configura Cabeçalhos de Host HTTPS e garante que o site padrão e o site de dinâmica sejam especificamente atribuídos ou vinculados a um determinado cabeçalho de host ou IP. Você sempre pode atribuir vários IPs à mesma NIC na máquina.
Comando do cabeçalho de host SSL do IIS:
appcmd set site /site.name:"Name of Website in IIS" /+bindings.[protocol='https',bindingInformation='*:443:Host Header']