Não, o vsftpd não suporta isso. O Proftpd pode, no entanto, lidar com isso usando o módulo mod_rewrite . Especificamente
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine on
RewriteMap lowercase int:tolower
RewriteCondition %m USER
RewriteRule (.*) ${lowercase:$1}
</IfModule>