Se você estiver familiarizado com a linha de comando, faça a mesma coisa com uma resposta: link MAS tenha cuidado e você deve saber o que está fazendo, porque alguns comandos usam superusuário a> -direitos!
... talvez escreva um pequeno roteiro e tudo é feito com apenas um clique! ; -)
enfim, eu recomendaria usar o BleachBit : é um bom limpador de arquivos com uma GUI e ( também no modo superusuário) você dificilmente pode atrapalhar o seu sistema.
abra seu terminal e apenas digite sudo apt-get update && sudo apt-get install -y bleachbit , digite sua senha (nenhum caractere será exibido) e aguarde até que seja executado.