O método mais seguro é derrubar o banco de dados mestre e copiar os arquivos binários do banco de dados do mestre para o escravo, trazê-los para cima e iniciar a replicação. Com 350Gb de tabelas, posso entender que isso pode ser uma solução problemática. Você pode ganhar algum tempo fazendo a cópia o mais rápido possível, o que geralmente significa copiar para um conjunto totalmente diferente de discos no servidor mestre. Então você pode trazer o mestre de volta e você pode levar o seu tempo movendo a cópia através de um link de rede mais lento.
Copiar arquivos MyISAM fora do MySQL irá funcionar, ou pelo menos eu sei que aconteceu nos dias do MySQL v3 e v4. (Certifique-se de ter o escravo desligado quando você executa myisamchk
.) No entanto, isso não funciona para arquivos InnoDB.
Existe uma ferramenta chamada "MySqL Hot Backup", ou algo assim é capaz de fazer tudo isso de uma maneira mais inteligente. O problema é que você pode ter que pagar por isso, pelo menos pelo suporte do InnoDB.