Você se deparou com o que eu chamo de "golpe de inicialização" - veja esta página da documentação do rEFInd para detalhes. Você pode obter o rEFInd boot novamente digitando sudo refind-mkdefault
em uma janela do Terminal do Ubuntu. Se isso não funcionar, você pode tentar reinstalar o rEFInd no OS X (preferencial) ou no Ubuntu (se necessário). A página mencionada anteriormente fornece métodos adicionais de recuperação.
Dada a ordem em que você instalou o software, você pode querer instalar o driver ext4fs (ou qualquer outro sistema de arquivos do seu kernel) para EFI, conforme descrito no página de drivers rEFInd. Como está agora, é provável que este driver não esteja instalado, o que significa que o rEFInd inicializará o Ubuntu apenas via GRUB; mas uma inicialização mais direta do kernel é às vezes mais confiável e mais fácil de manter. Para fazer isso, mais inicialização direta, no entanto, o driver do sistema de arquivos EFI é necessário.