Absolutamente. No mínimo, você deve iniciar o MySQL com as 4 opções a seguir (defina como você precisa, é claro):
- - porta 3307
- - soquete /var/tmp/new_mysql.sock
- - pidfile /var/run/new_mysql.pid
- - datadir / home / myuserid / dbdir
Você também deve ser capaz de definir esses valores em um novo arquivo my.cnf e apontar a nova instância para esse arquivo my.cnf quando ele for iniciado.
Aqui está a referência do MySQL sobre como fazer isso: link