Você está próximo, mas seu problema é que você tem as duas instâncias apontando para o mestre. O que você quer é uma instância atualizando o mestre a cada segundo, e a segunda instância lendo o escravo a cada segundo.
Observe também que ele não precisa ser executado nos servidores reais de banco de dados, ele usa uma conexão regular do cliente mysql. Eu corro o meu do meu servidor cacti. Aqui está o meu /etc/rc.local higienizado para um exemplo:
/usr/bin/mk-heartbeat -D maatkit -u maatkit -paardvark --update -h sql-master.fake.net --daemonize /usr/bin/mk-heartbeat -D maatkit -u maatkit -paardvark -h sql-slave.fake.net --monitor --file /tmp/sql-slave.heartbeat --daemonize