O PostgreSQL deve ser compatível entre versões menores, mas não com versões principais. I.E. 8.3.0 e 8.3.1 devem ser compatíveis entre si, mas 8.3.0 e 8.4.0 não serão. Versões menores são apenas correções de bugs, então você não deve ter nenhum problema. Como diz depesz, você precisa ter certeza de que a arquitetura é a mesma.
Se você não tem versões compatíveis, pode usar algo como slony para replicar em diferentes versões.