"estou correndo o risco de sobrescrever quaisquer existentes?"
Sim, mas o ssh-keygen pergunta ao "arquivo no qual salvar a chave".
"Eu quero ter certeza de que não vou interferir com as credenciais existentes que eles configuraram"
Em seguida, especifique o arquivo de chave alternativo.
> ssh-keygen
Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/home/username/.ssh/id_rsa): ^C