Para o Tomcat 6, eu monitorei pools de threads usando: Catalina: type = ThreadPool, *
Não tem certeza se você precisa de estatísticas no nível do aplicativo - se sim, alguns dos MBeans que você pode achar interessantes são:
- Atividade do servlet: Catalina: j2eeType = Servlet, * (tenho certeza de que há um para o JSP também)
- DataSource: Catalina: type = DataSource, *
- Acertos do cache: Catalina: type = Cache, *
Nota: Eu suponho que estes nomes de objeto são os mesmos no Tomcat 7