Tem certeza de que não é o CMS que gera o redirecionamento? Nada na sua configuração ou o funcionamento do nginx geraria esse tipo de resposta.
Vamos tentar descartar a barra à direita, se existir, e ver se isso apazigua o CMS de redirecionar?
if ($request_filename !~ "\.(js|htc|ico|gif|jpg|png|css)$") {
rewrite ^/(.*?)/?$ /$controller/$siteName/$1 last;
}