O MGET não faz parte do protocolo FTP, portanto, o limite (se houver) depende do seu cliente FTP, que deve implementar o MGET como uma série de comandos GET.
Parece que você pode estar usando o cliente FTP da linha de comando que vem com o Windows, nesse caso eu não ficaria surpreso se tivesse o bug que você descreveu - que é provavelmente o pior cliente FTP que eu ve sempre usado. Eu sugiro strongmente encontrar outro cliente FTP - existem muitos disponíveis para o Windows - mesmo para a linha de comando.