O ESXi cria automaticamente o primeiro armazenamento de dados e armazena alguns arquivos / pastas ocultos para coisas diferentes, como HA e logs.
A única maneira de eu ter sido bem sucedido em apagá-lo é inicializar o host com um live cd do gparted e excluir a partição. Depois, o ESXi encontrará um novo local para seus arquivos e você poderá adicionar um novo armazenamento de dados com o tamanho de bloco de 8 MB.
Aviso padrão: AVISO. REMOVER UMA PARTIÇÃO APAGARÁ QUALQUER VMS NO DATASTORE. BACK STUFF UP.
Boa sorte!