(Obviamente, isso está aqui há algum tempo. Se você já resolveu o problema, eu adorei ouvir como você fez isso ...)
Você menciona uma "migração de domínio". Se a máquina do Windows Server 2003 que hospeda o compartilhamento WebDAV não for um controlador de domínio (o que provavelmente não é), o nome NetBIOS do domínio foi alterado, e você está usando a autenticação básica que pode encontrar que alterar o nome de domínio especificado nas propriedades básicas de autenticação do compartilhamento WebDAV ajudará.
Além disso, eu começaria a farejar o tráfego. Primeiro, eu observaria a autenticação entre o cliente e o servidor WebDAV. O ideal é que você não esteja autenticando em texto puro, mas ainda seria bom ver o que está atingindo o fio.
Depois disso, eu aumentaria a auditoria no servidor WebDAV e verificaria o que atinge o log de eventos de segurança.
Finalmente, eu consideraria farejar o tráfego no servidor WebDAV para os controladores de domínio durante uma tentativa de autenticação, apenas para ver se tudo está de acordo com o que você espera que aconteça.