Estou tendo o mesmo problema. Se você estiver usando o CloudFormation para implantar suas instâncias e / ou fluxos de logs, a melhor maneira que encontrei para fazer isso é anexar uma referência ao seu ID da instância ao final do nome da sua métrica.
"MetricTransformations": [
{
"MetricValue": "1",
"MetricNamespace": "myNamespace",
"MetricName": { "Fn::Join": [ "", [ "myMetric - ", { "Ref" : "InstanceID" }] ] }
}
O que seria legal se você pudesse de alguma forma associar seus fluxos de log como uma dimensão em uma única métrica, em vez de criar um para cada instância.