Como você falou sobre um painel de fantoches, eu vou fazer a afirmação de que você está no Puppet-Enterprise.
Para desabilitar o agente de um nó, você pode fazer o seguinte:
Para fazer no cliente:
cd /etc/init.d
service pe-mcollective stop
service pe-puppet stop
rm pe-mcollective
rm pe-puppet
rm /etc/puppetlabs/mcollective/ssl/clients/peadmin-public.pem
rm /etc/puppetlabs/mcollective/ssl/clients/puppet-dashboard-public.pem
Em seguida, no mestre dos fantoches, por meio do painel, você pode remover esse nó específico na exibição do nó.
Você pode encontrar mais informações oficiais: link