Você pode desativá-lo manualmente com sudo hciconfig hci0 down , mas uma regra do udev pode funcionar também com gksudo gedit /etc/udev/rules.d/10-local.rules e digitar o seguinte
ACTION=="add", KERNEL=="hci0", RUN+="/usr/bin/hciconfig hci0 down"
Salvar, sair e reinicializar