Eu esperaria de um lançamento do Ubuntu LTS como o seu para ter a última versão estável de todos os softwares que você mencionou. Você tem 2 anos no período de suporte de 5 anos do seu lançamento, então acho que isso é uma expectativa razoável.
Atualizar para o 14.04 não parece ser uma ótima ideia. A atualização é uma operação delicada que não deve ser tomada de ânimo leve potencialmente um grande obstáculo. O período de suporte de 14.04 terminará um ano antes do atual, então você teria que atualizar um ano antes.
Para atualizar o software listado, você pode usar este comando:
apt-get install names_of_packages
Isso atualizará somente os pacotes selecionados. Se você não se importa, é bom manter todo o seu sistema atualizado, com:
apt-get upgrade
Se, por outro lado, a versão do Apache / MySQL empacotada com 12.04 é realmente muito antiga para você, então você pode querer considerar a instalação da versão mais recente a partir do código-fonte. No entanto, neste ponto, os benefícios dessa abordagem em relação à atualização para o 14.04 tornam-se questionáveis.
Em qualquer caso,
antes de fazer qualquer mudança importante ( apt-get install
ou apt-get upgrade
não contam como grandes mudanças, elas devem ser seguras),
Eu recomendo criar um sistema clone (no VirtualBox ou outro),
exporte suas configurações atuais e reimporte no clone e teste com cuidado.