Veja Virtualização de aplicativos para serviços de terminal isso pode estar mais perto do que você está tentando alcançar . É um recurso do Windows Server 2008.
Em 2003, você terá que analisar a política de grupo para bloquear o perfil de usuário dos serviços de terminal, processamento de loopback & Os perfis obrigatórios podem ajudar com isso.
Sua outra alternativa é a Citrix.