Claro - mas isso só pode ser feito com a VM executando seu licenciamento que permite o Storage VMotion.
Caso contrário, você desligará a VM e cancelará o registro ("remover do inventário"), depois no navegador do armazenamento de dados, selecione o diretório da VM e selecione a opção "mover" (o pequeno papel com uma seta) na parte superior painel. Depois disso, localize a VM no novo local no navegador do armazenamento de dados, clique com o botão direito no arquivo .vmx e registre-o. Quando estiver inicializando, perguntará se foi movido ou copiado; selecione movido.