Nem nem. Isso é feito durante a configuração do servidor da Web (que, pelo menos no Windows, é uma etapa diferente da instalação do certificado no armazenamento de certificados da máquina). O certificado SSL não é reproduzido na configuração - qualquer certificado SSL válido para um determinado domínio pode manipular IP e SNI.
O SNI é algo que basicamente entra na negociação entre o navegador e o servidor web. Se o servidor suportar SNI e o navegador decide enviar os cabeçalhos relevantes, o servidor pode manipular a conexão adequadamente.