Acontece que eu deveria ter mordido a bala ... O dry run estava apenas exibindo os diretórios que ele explora, mas não os arquivos reais.
Eu rodei o rsync de verdade e tudo deu certo, ele pulou tudo para além de uma ou duas novas adições.
Para referência, isso funcionou;
sudo rsync -avzs --ignore-existing --progress '/ media / Storage / OSs /' 'Usuário @ MyDomain: / mnt / Storage / OSs /'
Apologies All