Não tenho certeza se isso pode ser respondido definitivamente, já que o Dropbox pode mudar tudo ou nada amanhã. Eu não sou nem Dropbox nem a entidade onipotente que os impulsiona.
Dito isso, a resolução de links simbólicos é um recurso que permite que as pessoas sincronizem coisas que não estão realmente em suas pastas de caixa de depósito. Isso é útil se você quiser fazer algo sem realmente movê-lo. Dado que é assim que funciona atualmente e é como as pessoas estão usando, acho muito duvidoso que eles mudem esse comportamento ...
Desde que escrevi isso, encontrei uma dúzia de tópicos e perguntas na Internet que parecem concordar. Uma resposta sobre SU sugere a sincronização seletiva como solução alternativa.