você deve tentar investigar qual era o problema. verifique se há / var / log / messages antes de reinicializá-lo e outros logs por hora.
do que você pode tentar configurar algo como virtualbox para fins de teste e executar seus servidores principais nele. Isso diminuirá a produtividade, mas adicionará alguma estabilidade e você poderá acessá-la.
verifique também se há atualizações automáticas. eles poderiam comer o seu CPU.