Embora nada impeça o Postfix de entregar e-mails para um MDA que armazena o e-mail recebido em um banco de dados SQL (maildrop-mysql existe, AFAIK), não faria sentido se servidores comuns IMAP como Cyrus, Courier ou Dovecot estão envolvidos para acessar o correio, pois eles não podem usar um banco de dados SQL como um back-end de armazenamento.
Além disso, eu consideraria a afirmação de que armazenar os e-mails em um banco de dados MySQL é mais seguro e mais rápido do que simplesmente errado. Se as permissões corretas estiverem configuradas nos maildirs e o Dovecot estiver corretamente configurado e atualizado, não será mais seguro, já que todos que podem ler os arquivos maildir provavelmente conseguirão obter um dump das tabelas SQL também . E como o Dovecot etc. é altamente otimizado para trabalhar com grandes volumes de e-mails, não vejo como usar um banco de dados SQL com toda a sobrecarga (e a falta de estruturas de dados de árvore) ofereceria um benefício de desempenho.
Diga ao seu colega que tudo isso não faz sentido.