Sua instância do Amazon EC2 é, em si, uma máquina virtual e não há "BIOS" da maneira que você quer dizer. E a Amazon não suporta qualquer forma de virtualização aninhada acelerada.
Isso significa, entre outras coisas, que você não pode usar o VirtualBox dentro de uma instância do EC2 para executar convidados de 64 bits. (Você poderia, em teoria, executar convidados de 32 bits não acelerados, mas seria dolorosamente lento e caro.)
Você não explicou o que está tentando realizar, mas seja o que for, usar o VirtualBox em uma instância do Amazon não será o caminho para alcançá-lo.