Tente adicionar o soquete ao my.cnf na diretiva do cliente.
[mysql]
# CLIENT #
port = 3306
socket = /home/mysql/mysql.sock
[mysqld_safe]
socket = /home/mysql/mysql.sock
nice = 0
[mysqld]
# GENERAL #
user = mysql
default-storage-engine = InnoDB
pid-file = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket = /home/mysql/mysql.sock