O Poptop não parece ter qualquer suporte para o IPv6. E os seus mantenedores recomendam que você não o use de qualquer maneira, por motivos de segurança .
PPTP is known to be a faulty protocol. The designers of the protocol, Microsoft, recommend not to use it due to the inherent risks. Lots of people use PPTP anyway due to ease of use, but that doesn't mean it is any less hazardous. The maintainers of PPTP Client and Poptop recommend using OpenVPN (SSL based) or IPSec instead.
Versões recentes do O OpenVPN suporta IPv6 , então essa é provavelmente a sua melhor aposta durante a transição.