Instale um novo servidor 2008 ... junte-o ao domínio, promova-o para ser um controlador de domínio, transfira todos os papéis FSMO para ele. Em seguida, rebaixe o antigo, remova-o do domínio e reinstale como quiser.
Lembre-se de que você pode estar usando esse primeiro servidor para outras coisas, DNS, DHCP, etc.
O segundo servidor deve trazer automaticamente o DNS para você e mover todos os registros. Você deve sempre ter no mínimo dois controladores de domínio.