Dado que você só tem 4 discos rígidos para usar, você praticamente se limita. Configure dois arrays RAID 1, dois discos cada. No primeiro coloque o sistema operacional e tempdb. Na segunda matriz, coloque os bancos de dados do usuário. À medida que o servidor sharepoint cresce, você precisa adicionar mais discos, movendo os logs e bancos de dados para separar os arrays RAID e movendo o banco de dados tempdb para sua própria matriz RAID.
Tudo depende do número de usuários que usarão o sistema. Se você tem apenas 10 a 30 usuários que não usam os bancos de dados sharepoint, não importa realmente como você define as coisas.