Para gerenciar clientes Linux, o OpenBSD será o melhor.
Para gerenciar clientes Windows, o Windows será melhor (e, na minha experiência, muito melhor!). Essencialmente, você pode esquecer qualquer outra coisa além das políticas de domínio mais básicas do estilo NT4.
O seu servidor BSD pode ser usado como um DC de backup. o Samba HOWTO para mais informações. Embora você possa ter que ter um nível funcional menor de sua floresta / domínio - veja as páginas do Samba novamente.