Se a calibração der errado também após a reinicialização, eu diria que isso parece um bug. Às vezes tenho problemas com o ponteiro do meu mouse ao alterar os modos de vídeo, alternando para o modo terminal ( Ctrl + Alt + F1 ) e voltando ao modo gráfico ( Ctrl + Alt + F7 ) redefine meu mouse nesses casos. Talvez isso também redefina sua calibração.