A saída de btrfs subvolume list / mostra várias capturas instantâneas de subvolume (aparentemente criadas por um acionador apt para backup). Eles podem exigir muito espaço em disco, se muitos blocos de arquivos forem alterados desde a criação do instantâneo e não aparecerem nas listagens de diretório (e, portanto, não contribuem para o uso do disco dos arquivos listados) .
Você pode excluir instantâneos antigos (ou todos) com btrfs subvolume delete [snapshot name] (consulte man 8 btrfs para detalhes) se achar que não precisa mais deles. Posteriormente, um serviço de kernel btrfs periodicamente (normalmente a cada poucos segundos) liberará o espaço em disco não utilizado em um minuto, aproximadamente.
Se você quiser desabilitar ou reconfigurar o acionador do apt, sugiro que você crie uma nova pergunta.
Em uma nota completamente diferente, sugiro adicionar o sinalizador ssd mount à sua partição raiz. /home já tem.