O CloudWatch no EC2 está ativado com a API do EC2 . Como você já criou as instâncias fora do CloudFormation, o CloudFormation não pode modificá-las. Você pode criar Alarmes com o CloudFormation, mas não pode ativar o monitoramento nas instâncias. Se você tiver o monitoramento ativado, poderá consultar as instâncias especificando as "Dimensões "propriedade no modelo.