Ah, /usr/lib/viewvc/make-database
script é incluído, no pacote viewvc-query
. Bobo de mim para perder aquele (ou eu estou muito cansado hoje).
Então, é uma questão simples:
sudo /usr/lib/viewvc/make-database
... que irá solicitar o nome de usuário, a senha e o nome do banco de dados do MySQL. (Observe que isso limpa todos os dados de confirmação se um banco de dados ViewVC com esse nome já existia.)
Depois disso, sudo /usr/lib/viewvc/svndbadmin -v rebuild /path/to/repo
funciona bem.
Obrigado e desculpe.